Biotin-PD 167 与 Click-PD 213:专属背景库怎么用
分子互作富集试剂盒 · 产品选型 · NSB 与 DEMO
背景蛋白不干净,互作结果就不可信:5 套 NSB 库与 20+ DEMO 方案的价值
IP-NSB 人 1114 / 鼠 1036 / 大鼠 647 · PD-NSB 167 与 213
质谱筛互作,真正难的是"排除"。一次 Co-IP 能拉到上千个蛋白,其中大多数不是特异互作,而是粘在磁珠和抗体上的背景。没有专属背景库,就只能靠经验一条条删,既慢又容易误删。
一、NSB 是什么,为什么必须"专属"
NSB(non-specific binding)指在富集过程中非特异性粘附的蛋白。不同磁珠、不同抗体、不同裂解液,粘附谱是不一样的。用别人的背景库过滤自己的数据,很容易把真互作当背景删掉。这套产品给出的 5 套库,是按试剂盒体系分别构建的:
| 数据库 | 覆盖 | 规模 |
|---|---|---|
| IP-NSB(人) | IP/Co-IP 富集 | 1114 种 |
| IP-NSB(小鼠) | IP/Co-IP 富集 | 1036 种 |
| IP-NSB(大鼠) | IP/Co-IP 富集 | 647 种 |
| PD-NSB(Biotin-PD) | PD01–PD02 | 167 种 |
| PD-NSB(Click-PD) | PD03–PD06 | 213 种 |

先减背景,再谈候选,顺序不能反
二、过滤前后,候选名单差多少
没有背景库时,常用做法是"对照组出现即剔除",但低丰度蛋白在对照组里未必稳定出现,结果就是真假混杂。有专属库后,可以按出现频率 + 丰度比双条件筛,候选名单会明显收窄,后续验证工作量随之下降。

背景过滤是流程中的固定一步,不是可选项
三、20+ 套 DEMO:把"怎么做"写清楚
DEMO 方案覆盖四类研究:差异蛋白质组 5 套、蛋白质互作 9 套、小分子靶点 5 套、lncRNA-结合蛋白 1 套。每套都从样本制备写到质谱检测与数据分析,可以直接照着排实验。
| 研究方向 | DEMO 数量 | 典型组合 |
|---|---|---|
| 差异蛋白质组 | 5 | SILAC 培养基 + MGDK |
| 蛋白质互作 | 9 | IP01 + MGDK01/02(含 SILAC-IP、膜蛋白、交联 IP) |
| 小分子靶点 | 5 | PD01/PD03/PD05 + MGDK02(含 SILAC-PD) |
| RNA-蛋白互作 | 1 | SILAC-RNA-PD + MGDK01 |
对初次做这类实验的课题组,DEMO 的实际用途是给出可执行的对照设置与样本量参考,避免"照着论文写方法、做出来对不上"的常见问题。

产品 + 方案 + 背景库,三件一起交付
四、数据质量是可以被设计出来的
把 NSB 过滤、阳性对照、空珠对照、Input 对照四件事在设计阶段定好,后面就不需要靠"多跑几遍"来补救。质谱机时很贵,返工更贵。
落地建议
先选一套与你方向贴近的 DEMO,按它的对照设置跑一遍;拿到数据后,用对应 NSB 库过滤,再决定是否扩大样本量。

数据质量的起点,是标记效率达标

背景库对应的正是这一步产生的非特异结合

20+ 套方案,选一套贴近的照着跑
锲诺医药 · 质谱级一站式分子互作富集试剂盒
SILAC 标记 · IP/Co-IP · 小分子靶点 PD · 质谱前处理 · NSB 与 DEMO
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